Admission Predictors of In-Hospital Mortality and the Combined Outcome of Death or Invasive Mechanical Ventilation in Patients with COVID-19 During the Pre-Vaccination Era: A Retrospective Cohort Study

Cette étude de cohorte rétrospective menée au Brésil avant la vaccination a identifié cinq facteurs prédictifs indépendants de la mortalité hospitalière chez les patients COVID-19 : l'âge, le pH artériel, le rapport neutrophiles/lymphocytes, le nombre de comorbidités et la créatinine sérique.

Rassi, A., Rassi, V. M., Garcia, J. V. R. + 11 more2026-03-03📄 infectious diseases

Plasmodium falciparum Carriage in central and northern Mali amid Seasonal Malaria Chemoprevention implementation

Cette étude menée au Mali révèle que la mise en œuvre de la chimio-prevention saisonnière modifie la répartition de l'âge du réservoir de *Plasmodium falciparum*, soulignant l'importance de cibler les porteurs asymptomatiques âgés de 10 à 24 ans pour réduire davantage la transmission dans les zones saisonnières.

Kazanga, B., Cissoko, M., KATILE, A. + 19 more2026-03-02📄 infectious diseases

Influence of microbial composition and sample type on antimicrobial resistance in urinary tract infections: a single-centre retrospective cohort study (2015-2023)

Cette étude rétrospective monocentrique menée à Zurich démontre que le type d'échantillon urinaire et la composition microbienne polymicrobienne influencent significativement la prévalence et le profil de la résistance aux antimicrobiens, fournissant ainsi des données essentielles pour optimiser le traitement empirique des infections urinaires.

Dubey, A. K., Reyes, J., Rhiner, C. + 4 more2026-03-02📄 infectious diseases

The Representativeness of Regional Influenza Virus Genomic Surveillance for National Trends in the United States

Le séquençage génomique dense de la grippe réalisé dans un seul État américain a permis de capturer presque toute la diversité des haplotypes circulant au niveau national, la rapidité de détection étant principalement déterminée par l'effort de séquençage et la fréquence des haplotypes.

Ragonnet-Cronin, M., Papalambros, L., Bendall, E. E. + 5 more2026-03-02📄 infectious diseases

Diagnostic Accuracy of an Immunoassay Using Avidity-Enhanced Polymeric Peptides for SARS-CoV-2 Antibody Detection

Cette étude démontre qu'un ELISA utilisant le peptide polymérisé S559, conçu pour exploiter l'avidité, offre une sensibilité et une spécificité élevées pour la détection sérologique du SARS-CoV-2, constituant ainsi une alternative prometteuse aux antigènes entiers pour les diagnostics à faible coût.

Pollo, B. A. L. V., Ching, D., Idolor, M. I. + 3 more2026-03-02📄 infectious diseases

Development of a Rapid Automated Point-of-Care Test for Mycobacterium tuberculosis Detection from Tongue Swabs and Sputum Specimens on the DASH(R) Rapid PCR System

Cette étude présente le développement et la validation d'un test PCR rapide et automatisé sur le système DASH® pour la détection de la tuberculose à partir d'échantillons de crachats et d'écouvillons de langue, démontrant une haute sensibilité et spécificité ainsi qu'une compatibilité avec les environnements à ressources limitées grâce à son fonctionnement sur batterie et sa stabilité thermique.

Butzler, M., Reed, J., Olson, A. + 8 more2026-03-02📄 infectious diseases

A model-based evaluation of the cost-effectiveness of paediatric and elderly vaccination against pneumococcal infection in England

Cette étude présente un modèle épidémiologique et économique évaluant la rentabilité des programmes de vaccination antipneumococcique en Angleterre, concluant que le passage aux vaccins PCV13 et PCV20 pour les enfants et les personnes âgées est rentable malgré les défis posés par le remplacement des sérotypes.

Keeling, M. J., El Deeb, O. J., Tran, P. B. + 2 more2026-03-02📄 infectious diseases

Inactivated Japanese encephalitis virus vaccination imprints fusion loop-biased antibody responses that are attenuated by repeated live-attenuated dengue vaccination

L'étude démontre que la vaccination préalable contre la fièvre japonaise B (JEV) imprime une réponse anticorps biaisée vers l'épitope de la boucle de fusion du virus de la dengue, ce qui favorise l'amélioration dépendante des anticorps, mais que cette empreinte immunitaire est atténuée par une série complète de vaccins vivants atténués contre la dengue qui réorientent la réponse vers des épitopes non conservés.

Mpingabo, P. I., Adekomi, E. I., Ware, L. A. + 7 more2026-03-02📄 infectious diseases

Metabolomic atlas of dengue virus-infected individuals unveils unique bioactive lipid imprints in the systemic circulation

Cette étude utilise la spectrométrie de masse à haute résolution pour révéler des empreintes lipidiques bioactives uniques dans le sérum des patients infectés par le virus de la dengue, identifiant notamment des métabolites comme le diacylglycérol et la lysophosphatidylcholine 22:6 qui interagissent fortement avec les protéines virales et pourraient servir de biomarqueurs pour le diagnostic et le pronostic.

Anshad, A. R., Atchaya, M., Saravanan, S. + 6 more2026-03-02📄 infectious diseases

A multi-region discrete time chain binomial model for infectious disease transmission

Cet article propose un cadre de modèles binomiaux en chaîne à temps discret multi-régions pour analyser la transmission spatiale des maladies infectieuses en intégrant les interactions entre régions, les interventions sanitaires et les facteurs sociodémographiques, tout en offrant des méthodes d'estimation et de prévision validées par des données réelles et des simulations.

Sinha, P. K., Mukhopadhyay, S.2026-02-28📄 infectious diseases

Digital health app data reveals an effect of ovarian hormones on long COVID and myalgic encephalomyelitis symptoms

Une analyse rétrospective de données d'applications de santé numérique révèle que les symptômes du COVID long et de l'encéphalomyélite myalgique s'aggravent durant les menstruations et sont atténués par la contraception hormonale combinée, suggérant un rôle modulateur des hormones ovarienne sur ces pathologies.

Goodship, A., Preston, R., Hicks, J. T. + 5 more2026-02-27📄 infectious diseases

Estimating malaria attributable fraction using quantitative PCR in a longitudinal cohort in Eastern Uganda

Cette étude menée en Ouganda oriental démontre que l'utilisation de la PCR quantitative pour estimer la fraction attribuable au paludisme révèle que les seuils de densité parasitaire couramment utilisés sous-estiment considérablement l'incidence réelle du paludisme clinique, en particulier chez les adultes et les enfants.

Martin, A., Wang, Q., Babirye, S. + 14 more2026-02-27📄 infectious diseases

Clinical validation of a novel metagenomic nanopore sequencing method for detecting viral respiratory pathogens: diagnostic accuracy study

Cette étude de validation clinique démontre que, bien que le séquençage métagénomique nanopore présente un potentiel diagnostique pour la détection de virus respiratoires dans des écouvillons nasopharyngés, sa sensibilité actuelle reste limitée (51 % par rapport à la PCR) en raison des défis liés à la forte biomasse de l'hôte, soulignant la nécessité de définir des cas d'utilisation optimaux et des seuils bioinformatiques rigoureux pour minimiser les faux positifs.

Sanderson, N. D., Dingle, K. E., Hopkins, K. M. V. + 14 more2026-02-26📄 infectious diseases

Strengthening diagnostic capacity for viral hemorrhagic fevers in Forest Guinea: advances in case detection and surveillance

La mise en place d'infrastructures de laboratoire durables et la formation de personnel local en Guinée forestière ont considérablement renforcé la détection précoce, la surveillance et la réponse aux fièvres hémorragiques virales, notamment Ebola, Marburg et la fièvre de Lassa, entre 2017 et 2024.

Koundouno, F. R., Sidibe, Y., Millimono, S. L. + 33 more2026-02-26📄 infectious diseases